Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSG1Q9BU20 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms