Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF559Q9BR84 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms