Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms