Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CICQ96RK0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CICQ96RK0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CICQ96RK0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms