Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC4A9Q96Q91 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC4A9Q96Q91 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms