Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERCC4Q92889 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC4Q92889 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms