Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNERQ8NFT8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNERQ8NFT8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNERQ8NFT8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNERQ8NFT8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNERQ8NFT8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNERQ8NFT8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNERQ8NFT8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNERQ8NFT8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms