Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARRDC4Q8NCT1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms