Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG16L2Q8NAA4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms