Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVOPQ8N4V2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVOPQ8N4V2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms