Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GBP6Q6ZN66 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GBP6Q6ZN66 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms