Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED9Q6R2W3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms