Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDF6Q6KF10 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDF6Q6KF10 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms