Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATL3Q6DD88 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATL3Q6DD88 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms