Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CLQ60I27 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALS2CLQ60I27 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms