Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF18Q5VWM3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF18Q5VWM3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms