Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDLRAD1Q5T700 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms