Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms