Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms