Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6CQ53S08 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6CQ53S08 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms