Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD8Q15843 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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