Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITSN1Q15811 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITSN1Q15811 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITSN1Q15811 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITSN1Q15811 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITSN1Q15811 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITSN1Q15811 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITSN1Q15811 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITSN1Q15811 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITSN1Q15811 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITSN1Q15811 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITSN1Q15811 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
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