Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RAB39AQ14964 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RAB39AQ14964 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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RAB39AQ14964 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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