Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SMCO1Q147U7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SMCO1Q147U7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SMCO1Q147U7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SMCO1Q147U7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SMCO1Q147U7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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