Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCOA4Q13772 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCOA4Q13772 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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