Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX3Q13761 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX3Q13761 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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