Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALCAMQ13740 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALCAMQ13740 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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