Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL28Q13084 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL28Q13084 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms