Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN3Q13064 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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