Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.79□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.79□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 HSL1YKL101W 4557 nt1.79□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.78□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 BLI1YKL061W 342 nt1.78□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 YOR093CYOR093C 4947 nt1.78□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 RTP1YMR185W 2946 nt1.78□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 CTF4YPR135W 2784 nt1.78□□□□□ -2.12
NOP56Q12460 ALK1YGL021W 2283 nt1.78□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 PBY1YBR094W 2262 nt1.78□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 MCM10YIL150C 1716 nt1.77□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 VPS55YJR044C 423 nt1.77□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 UFD2YDL190C 2886 nt1.77□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 TBS1YBR150C 3285 nt1.77□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 FAB1YFR019W 6837 nt1.77□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 NUT1YGL151W 3399 nt1.76□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.76□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 KIP1YBL063W 3336 nt1.76□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 YGL217CYGL217C 342 nt1.75□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 PFD1YJL179W 330 nt1.75□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.75□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 YBR174CYBR174C 315 nt1.75□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 GYP5YPL249C 2685 nt1.75□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 SMC4YLR086W 4257 nt1.74□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 YDR521WYDR521W 336 nt1.74□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 COF1YLL050C 432 nt1.74□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 YOR376WYOR376W 369 nt1.74□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 NPR2YEL062W 1848 nt1.74□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 YLL054CYLL054C 2532 nt1.74□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 IFH1YLR223C 3258 nt1.73□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 SLX4YLR135W 2247 nt1.73□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 RRT15YLR162W-A 189 nt1.73□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 SPC110YDR356W 2835 nt1.73□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 ADR1YDR216W 3972 nt1.72□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 MON2YNL297C 4911 nt1.72□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 YJL022WYJL022W 309 nt1.72□□□□□ -2.13
NOP56Q12460 DNF3YMR162C 4971 nt1.71□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 KCS1YDR017C 3153 nt1.71□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 SGF11YPL047W 300 nt1.71□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 AIM44YPL158C 2277 nt1.71□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 snR74snR74 88 nt1.7□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.7□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 NCA2YPR155C 1851 nt1.7□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 PIP2YOR363C 2991 nt1.69□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YLR140WYLR140W 327 nt1.69□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.69□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.69□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YBR206WYBR206W 324 nt1.69□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 IRA1YBR140C 9279 nt1.69□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YOR019WYOR019W 2193 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YDL206WYDL206W 2289 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 APQ12YIL040W 417 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 MMS4YBR098W 2076 nt1.68□□□□□ -2.14 RIP-Chip
NOP56Q12460 CHS1YNL192W 3396 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 ALY2YJL084C 3141 nt1.67□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YOR302WYOR302W 78 nt1.67□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YKU70YMR284W 1809 nt1.67□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 TRM3YDL112W 4311 nt1.67□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.66□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 POL5YEL055C 3069 nt1.65□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 BST1YFL025C 3090 nt1.65□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 YLR419WYLR419W 4308 nt1.65□□□□□ -2.14
NOP56Q12460 PET127YOR017W 2403 nt1.65□□□□□ -2.15 RIP-Chip
NOP56Q12460 FYV8YGR196C 2454 nt1.65□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 AHC1YOR023C 1701 nt1.65□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 HKR1YDR420W 5409 nt1.65□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 snR14snR14 160 nt1.64□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 SLD3YGL113W 2007 nt1.64□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 SXM1YDR395W 2835 nt1.63□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 KAP122YGL016W 3246 nt1.63□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 SSK2YNR031C 4740 nt1.63□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.63□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 ISD11YER048W-A 285 nt1.63□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 ECM12YHR021W-A 456 nt1.63□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 FIG4YNL325C 2640 nt1.62□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 YNL337WYNL337W 255 nt1.62□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.62□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 PAN2YGL094C 3348 nt1.62□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 YCS4YLR272C 3531 nt1.62□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 CCH1YGR217W 6120 nt1.62□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 OLI1Q0130 231 nt1.61□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.61□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 PAM16YJL104W 450 nt1.59□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.59□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 YCL023CYCL023C 348 nt1.59□□□□□ -2.15
NOP56Q12460 PIK1YNL267W 3201 nt1.59□□□□□ -2.16 RIP-Chip
NOP56Q12460 YAR009CYAR009C 3591 nt1.58□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 SMC1YFL008W 3678 nt1.58□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 MEC1YBR136W 7107 nt1.57□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 AZF1YOR113W 2745 nt1.56□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 PMD1YER132C 5262 nt1.56□□□□□ -2.16 RIP-Chip
NOP56Q12460 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.56□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.56□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 YDL196WYDL196W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 YEL014CYEL014C 306 nt1.56□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 ULI1YFR026C 510 nt1.56□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 SWI4YER111C 3282 nt1.55□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 STO1YMR125W 2586 nt1.55□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 REV3YPL167C 4515 nt1.55□□□□□ -2.16
NOP56Q12460 SEC21YNL287W 2808 nt1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.2 ms