Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD47Q08722 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD47Q08722 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD47Q08722 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms