Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDK18Q07002 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDK18Q07002 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms