Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms