Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL23P62829 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL23P62829 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL23P62829 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms