Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFRD-1P60508 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms