Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP6P59044 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP6P59044 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms