Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BACE1P56817 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BACE1P56817 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BACE1P56817 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms