Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA2D1P54289 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms