Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFNA4P52798 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms