Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GNPDA1P46926 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms