Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHMBP2P38935 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms