Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HOXA10P31260 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms