Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD34P28906 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD34P28906 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD34P28906 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD34P28906 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD34P28906 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD34P28906 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms