Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLNP26678 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLNP26678 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PLNP26678 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms