Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPREP23469 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPREP23469 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPREP23469 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPREP23469 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPREP23469 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPREP23469 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPREP23469 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPREP23469 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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