Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXA5P20719 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXA5P20719 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXA5P20719 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HOXA5P20719 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA5P20719 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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