Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD53P19397 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD53P19397 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD53P19397 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD53P19397 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD53P19397 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD53P19397 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD53P19397 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD53P19397 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD53P19397 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms