Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN1P18031 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN1P18031 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms