Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMPD1P17405 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPD1P17405 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms