Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DOBP13765 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms